遠古時代,外星文明“澤諾帕雷斯”因過度開發耗盡母星,被迫將族群基因封存于移民戰艦,向宇宙深處尋找新家園“約定之星·特拉”。當他們終于抵達目的地,卻發現這顆星球早已被原始文明的人類占據,族群內部因此分裂為主張武力占領的強硬派與尋求和談的溫和派。戰敗的溫和派孤注一擲,將三臺“澤農守護者”機甲連同戰艦送往地球,落入江戶時代的日本蝦夷、江戶與薩摩等地并被深埋地下。時光流轉至今,強硬派卷土重來發動侵略,北海道、東京、鹿兒島的少年少女們喚醒沉睡的機甲,肩負起守護地球的使命。